Recorde as incidências da partida
Com o tempo a esgotar-se, Behich aproveitou o passe recuado de Riley McGree e fez o golo que decidiu a partida, para gáudio de uma multidão de 57.226 pessoas que apoiaram uma exibição esforçada dos Socceroos.
A Austrália mantém-se em segundo lugar no Grupo C, atrás dos já qualificados japoneses, e passará à fase final se a Arábia Saudita, terceira classificada, não vencer o Bahrein em Riffa, ainda esta quinta-feira.
Mesmo que o resultado posterior no Bahrein lhes seja desfavorável, a superior diferença de golos da Austrália significa que irão para o sexto Mundial consecutivo, salvo uma pesada derrota quando defrontarem os sauditas em Jeddah na próxima terça-feira.
"É uma sensação ótima", disse Behich. "Foi um jogo difícil. Sabíamos que tínhamos de lutar. No intervalo, o treinador disse que, por mais difícil que fosse, teríamos a nossa oportunidade se continuássemos firmes. E, felizmente, ela caiu para mim".
A primeira vitória da Austrália sobre os Samurais em 16 anos e a primeira derrota internacional do Japão desde fevereiro do ano passado pareciam altamente improváveis durante 89 minutos, até ao golo de Behich.
O Japão, que foi o primeiro país a qualificar-se para o Mundial, poupou a maioria dos seus principais jogadores e colocou em campo uma equipa com três estreantes, mas ainda assim dominou a posse de bola enquanto a Austrália lutava para se afirmar na partida.
Com pouca posse de bola, os Socceroos conquistaram o seu primeiro canto após meia hora, o que resultou no seu primeiro remate, uma cabeceamento para fora de Connor Metcalfe.
Apesar da posse de bola, os Samurais pouco incomodaram Mat Ryan na baliza australiana, com o novo capitão Yu Hirakawa a estar perto de marcar com um remate rasteiro que passou ao lado do poste aos 37 minutos.
O técnico da Austrália, Tony Popovic, fez duas alterações ao intervalo para tentar garantir mais posse de bola, mas a jovem equipa de Hajime Moriyasu manteve o seu domínio.
Os japoneses ainda careciam de eficácia no ataque, mesmo depois de um pouco mais de experiência vinda do banco, e o suplente Takefusa Kubo superou Ryan mas falhou o alvo com uma grande oportunidade aos 80 minutos.
A Austrália não desistiu, no entanto, e o suplente McGree finalmente produziu um momento de qualidade para driblar o defesa e chegar à linha de fundo antes de passar rasteiro para Behich marcar o golo que deixa os australianos a um pequeno passo do apuramento.