Formado no Benfica e no Sintrense, Fábio Baptista esteve no Sint-Truiden, da Bélgica, na temporada passada, antes de chegar ao Leixões, onde fez 24 jogos oficiais.
Agora, e depois de três temporadas no Benfica, ruma ao Mafra, mantendo-se na Liga 2, com vínculo válido por uma temporada e meia.
