Natural de Divinópolis, Rubens ingressou no Atlético-MG em 2016 para integrar o escalão sub-15. Desde então, construiu uma carreira sólida no clube, passando por todas as categorias de formação até se estrear pela equipa principal a 7 de março de 2021, numa vitória por 4-0 frente ao Uberlândia, no Mineirão, a contar para o Campeonato Mineiro.
Desde a estreia na equipa principal, Rubens somou 152 jogos com a camisola alvinegra, apontou 9 golos e foi peça importante em vários momentos do ciclo recente do Galo. Ao longo da sua passagem, conquistou seis títulos: o Campeonato Brasileiro de 2021 e cinco edições consecutivas do Campeonato Mineiro (2021 a 2025).
O jogador destacou-se pela sua versatilidade, atuando não apenas como médio, mas também como lateral-esquerdo em diversas ocasiões. A venda do atleta foi considerada uma oportunidade estratégica pela direção alvinegra, tanto do ponto de vista desportivo como financeiro.
Rubens despede-se do Galo deixando a sua marca como um dos principais talentos formados na academia do Atlético nos últimos anos.

