Guendouzi, de 26 anos, iniciou a sua carreira no Lorient antes de se transferir para o Arsenal em 2018. Após empréstimos ao Hertha Berlim e ao Marselha, ingressou definitivamente no Marselha em 2022 e assinou pela Lazio em 2024.
O Fenerbahçe anunciou no seu site oficial que assinou com Guendouzi um contrato válido por quatro anos e meio.