Os três juízes marcaram 116-112 a favor do ucraniano, que defende com êxito os seus títulos WBA (Super), WBO e WBC.
Usyk, o único homem a derrotar Fury nos seus 16 anos de carreira, também continua invicto. O seu recorde atualizado é de 23-0.
Os pontos de interrogação rodeiam agora Fury, que anunciou a sua reforma em 2022, antes de reverter essa decisão.
Para Usyk, vencer novamente o "Rei Cigano" cimentou ainda mais o seu lugar entre os grandes nomes do boxe.
"Ganhei, é bom. Obrigado, Deus", disse Usyk à BBC Sport, após o triunfo sobre Fury.
Sobre o seu adversário, acrescentou: "É um grande lutador. Foram 24 assaltos inacreditáveis para a minha carreira, obrigado".
Houve apelos para que Usyk lutasse contra o britânico Daniel Dubois - que estava presente - no seu próximo combate.
A resposta do ucraniano? "Não há problema, estou pronto. No próximo combate, não há problema".