Na primeira volta da corrida, Bezzecchi embateu na traseira da Ducati de Márquez e ambos foram projetados para a gravilha a grande velocidade, com Márquez a mostrar sinais evidentes de dor após uma queda aparatosa.
O espanhol, que conquistou o seu sétimo título de MotoGP no Grande Prémio do Japão na semana passada, ficou curvado ao lado da pista durante alguns minutos antes de se levantar com dificuldade e afastar-se, segurando o ombro.
Mais tarde, foi visto com o braço ao peito, e elementos da equipa Ducati afirmaram na transmissão da corrida que os primeiros exames indicavam uma fratura.
"Na sequência do acidente de hoje (domingo) no GP da Indonésia, Marc Márquez sofreu uma lesão na clavícula direita," comunicou a Ducati nas redes sociais.
"O piloto espanhol viajará esta noite para Madrid (Espanha) para realizar exames médicos adicionais e decidir o tratamento a seguir".
A lesão ocorreu no ombro do braço que Márquez fraturou no Grande Prémio de Espanha em Jérez, em julho de 2020, o que o afastou das pistas durante um longo período e obrigou a várias cirurgias.
"Não é a melhor forma de celebrar o campeonato," disse Márquez aos jornalistas após a corrida.
"No final, o Marco Bezzecchi já veio ter comigo e pediu desculpa. Isto acontece. Por vezes sou eu, outras vezes é outro piloto, mas não foi intencional. O Marco reconheceu que foi culpa dele".
"Vamos voar para Madrid e tentar perceber com os médicos exatamente o que se passa e tentar regressar o mais rápido possível".
Numa declaração à parte, a Aprilia confirmou que Bezzecchi também seria levado ao hospital para realizar exames mais detalhados após o acidente.
O colega de equipa de Márquez na Ducati, Francesco Bagnaia, Joan Mir (Honda HRC) e Enea Bastianini (Red Bull KTM Tech3) também caíram na corrida de domingo, que foi vencida pelo estreante Fermin Aldeguer.