Beatriz Fonseca iniciou a sua carreira na Fundação Laura Santos, antes de prosseguir a sua evolução com as cores do Estoril Praia, onde se foi afirmando gradualmente como uma das jogadoras mais rápidas e consistentes da equipa.
Após uma breve passagem pelo Apollon Limassol, no Chipre, onde conquistou todos os troféus nacionais, as suas exibições abriram-lhe as portas do SC Braga em 2022, clube no qual confirmou todas as suas qualidades, revelando-se decisiva tanto na frente da baliza como na construção de jogadas.
No verão de 2024, ingressou no Sporting. Nas leoas, Beatriz Fonseca atingiu um novo nível, afirmando-se como uma figura-chave no jogo ofensivo, conquistando a Supertaça de Portugal e ganhando experiência em competições europeias. Durante a época de 2024/2025, fez 13 assistências, antes de confirmar a sua consistência na época seguinte, com mais 14. As suas impressionantes exibições valeram-lhe as primeiras convocatórias para a seleção de Portugal, e Beatriz Fonseca chegou mesmo a participar no Europeu de 2025.
Depois de 58 jogos oficiais pelo Sporting, Beatriz Fonseca ruma agora ao Marselha.
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