Será a segunda passagem do técnico navarro pelo comando da equipa, que orientou até à final da Taça de Inglaterra em 2019.
Esteve no clube entre janeiro de 2018 e setembro do ano seguinte, conseguindo garantir a permanência na Premier League em ambas as épocas.
No entanto, um início de época negativo em 2019/20 deixou-o sem margem de manobra e acabou por ser despedido.
Num comunicado publicado no site oficial, o clube afirmou: "O Watford FC tem o prazer de confirmar o regresso de Javi Gracia como treinador principal, após a decisão de terminar a ligação com Paulo Pezzolano e a sua equipa técnica, a quem agradecemos sinceramente todo o empenho e dedicação demonstrados durante o tempo em funções".
"Desejamos-lhes o maior sucesso para o futuro".
Pezzolano, antigo treinador do Valladolid, orientou os Hornets apenas em 10 jogos, deixando a equipa atualmente na 11.ª posição do Championship.