Derrotados na 34.ª e última jornada pelo agora bicampeão Sporting (2-0), os vimaranenses foram ultrapassados pelo Santa Clara, que venceu o despromovido Farense (2-1), terminaram a prova no sexto lugar, com 54 pontos, e ficaram aquém de repetir as quatro qualificações seguidas para a antiga Taça UEFA, alcançadas entre as épocas 1994/95 e 1997/98.
A equipa minhota iniciou o campeonato com Rui Borges, treinador que se mudou para o Sporting em 26 de dezembro de 2024 para conquistar o seu primeiro título, entrou em 2025 com Daniel Sousa, timoneiro por 19 dias, e concluiu-a com Luís Freire, técnico que conduziu a recuperação do último terço, insuficiente para garantir o principal objetivo.
Contratado no final da época transata, Rui Borges apostou no sistema tático 4-2-3-1 que utilizara no Moreirense em 2023/24, encerrando um ciclo de duas épocas de 3-4-3 no Vitória, e montou uma equipa que venceu quatro dos cinco primeiros jogos, o último dos quais no terreno do rival SC Braga (2-0).

Terceiros classificados após cinco jornadas, os vimaranenses falharam a vice-liderança isolada quando receberam o FC Porto (derrota por 3-0), à sexta ronda, e iniciaram uma série de duas vitórias, cinco empates e três derrotas até o técnico natural de Mirandela rumar aos leões, por 4,1 milhões de euros (ME).
A transferência precedeu as contratações de Daniel Sousa, que comandou o Vitória perante Farense (2-2) e Sporting, num frenético 4-4, e de Luís Freire, oficializada a meio de um mercado de janeiro com as vendas de Alberto à Juventus, de Manu Silva ao Benfica e de Kaio César ao Al-Hilal, decisivas para o recorde vitoriano de 34 ME numa janela de transferências.
Com o ex-técnico do Rio Ave, os minhotos alcançaram 29 pontos na segunda volta, mais quatro do que na primeira, tendo invertido uma desvantagem de oito pontos para subir ao quinto lugar, antes de caírem de novo para sexto com os desaires das últimas duas jornadas.

O guarda-redes Bruno Varela foi totalista, o extremo Gustavo Silva, reforço para 2024/25, foi o melhor marcador, com sete golos, e o médio Tiago Silva destacou-se com cinco golos e quatro assistências, numa época abaixo dos 63 pontos de 2023/24, recorde absoluto do clube.