Hoyos, que até agora desempenhava funções como diretor desportivo do Inter Miami, sucede a Javier Mascherano, que deixou o clube por "motivos pessoais" na terça-feira, apenas quatro meses depois de ter conduzido a equipa ao seu primeiro título da MLS Cup.
Hoyos, de 62 anos, foi um dos principais mentores de Messi na equipa de formação do Barcelona há mais de vinte anos, mantendo-se próximos desde então.
"A amizade não é negociável. Partilhamos uma amizade que já dura há muitos anos. No entanto, essa amizade não significa que vamos estar sempre em cima dele ou a pressioná-lo todos os dias" afirmou Hoyos, em espanhol, na sua primeira conferência de imprensa.
Num primeiro comunicado, o clube referiu que Hoyos iria assumir o comando da equipa nos "próximos jogos", mas desde então passou a apresentá-lo como treinador principal nas publicações nas redes sociais.
Fontes do clube disseram à AFP que Hoyos deverá manter-se no cargo apenas até meados do ano, estando prevista uma nova equipa técnica para o início da Leagues Cup em agosto.
Após sete jornadas esta época, o Inter Miami ocupa o terceiro lugar na Conferência Este da MLS.
Messi, vencedor do Mundial 2022 e detentor de oito Bolas de Ouro, é a grande estrela do plantel do Miami.