Os internacionais Savinho, Abdukodir Khusanov e Claudio Echeverri não conseguiram encontrar um lugar no plantel na terça-feira, quando o City venceu o Bournemouth por 3-1. Os ingleses James McAtee e Rico Lewis também não foram convocados.
O City tem 28 jogadores na equipa principal, sem contar com quatro que estão emprestados, e tem um dos plantéis mais valiosos do mundo, com alguns meios de comunicação a avaliarem-no em mais de 1,3 mil milhões de euros.
"Eu disse ao clube ... Não quero deixar cinco ou seis jogadores no congelador", disse Guardiola aos jornalistas, depois de o City ter subido ao terceiro lugar, quando falta um jogo para o final da época.
"Não quero isso. Vou demitir-me. Façam um plantel mais curto e eu fico", atirou.
Apesar do seu enorme plantel, o City enfrentou uma crise de lesões no final do ano passado, com a equipa a entrar numa série de cinco jogos de derrotas em todas as competições entre outubro e novembro.
O City trouxe Omar Marmoush, Vitor Reis, Khusanov e Nico Gonzalez na janela de transferências de janeiro para ajudar a resolver o problema, mas com os defesas John Stones e Nathan Aké a serem os únicos dois jogadores atualmente lesionados, Guardiola disse que era "impossível" para a sua "alma" continuar a dizer a tantos jogadores que iriam assistir ao jogo das bancadas.
"É uma questão para o clube. Não quero ter 24, 25, 26 jogadores quando todos estão em forma. Se tiver lesões, por azar, temos alguns jogadores (da) academia", acrescentou o treinador.
Guardiola, que prolongou o seu contrato com o City até 2027 em novembro, vai liderar o clube na defesa do título do Mundial de Clubes no próximo mês.