Quarenta equipas avançaram para a 2.ª fase, que continua a ser disputada em jogo único. Tal como na primeira fase, o empate leva a decisão para a disputa de grandes penalidades.
Nesta 2.ª fase, os valores de prémio dependem do nível que cada equipa ocupa no panorama nacional. As equipas do Brasileirão recebem 347.600 euros pela participação, as da Segunda Liga lucram 295.500 euros e as restantes 185.000 euros.
A partir da 3.ª fase, o torneio conta com a presença de outros 12 clubes, já previamente classificados para formar os 32 restantes.
São eles: Botafogo, Flamengo, Palmeiras, Fortaleza, Internacional, São Paulo, Corinthians e Bahia (classificados à Libertadores), Cruzeiro (classificado pela posição no Brasileirão 2024), Santos (campeão da Série B 2024), CRB (campeão da Taça do Nordeste) e Paysandu (campeão da Taça Verde).
Haverá sorteio para a definição dos jogos da 3.ª fase, que acontecerá com dois jogos. Neste novo momento, os valores de prémio são de 445.800 euros para as equipas do Brasileirão, 445.800 euros para as da Série B e 445.800 euros para as restantes.
Confira todos os jogos da 2.ª fase da Taça do Brasil:
Maringá x União Carmolandense-TO
Red Bull Bragantino x São José-RS