Yamashita, que estava a celebrar o seu 24.º aniversário, tinha três pancadas de vantagem à entrada para a terceira jornada no Royal Porthcawl.
Mas depois de ter jogado 65 pancadas sem bogeys na sexta-feira, fez 74 pancadas, após uma saída errática do tee e dificuldades nos greens do campo galês, para chegar à jornada final de domingo com nove abaixo do par.
"Hoje vou olhar para o que correu mal e para o que correu bem e analisar o dia e fazer as melhorias que, espero, conduzam a uma melhor jornada amanhã", disse Yamashita, cujo melhor registo num major foi um empate no segundo lugar no Women's PGA Championship do ano passado.
"Os ventos estão muito fortes, o que torna a escolha dos tacos bastante difícil", acrescentou.
A sul-coreana Kim A-lim registou um resultado de cinco abaixo do par (67) no sábado para ficar a uma pancada de Yamashita, em segundo lugar.
Kim está a disputar o seu segundo major depois de vencer o US Women's Open em 2020, em Houston, quando não havia espectadores durante a pandemia da COVID-19.
"Honestamente, não estou focada na líder", insistiu Kim.
"Concentro-me no meu processo, na minha pancada e depois na minha posição", acrescentou.
Andrea Lee, dos Estados Unidos, também fez 67 pancadas e está em terceiro lugar.
Entretanto, a japonesa Minami Katsu fez sete birdies e um eagle para um brilhante 65 e subiu para partilhar o quarto lugar.
A Katsu juntou-se a inglesa Charley Hull, que começou o dia no par, a 11 pancadas da liderança, antes de aumentar as esperanças de uma vencedora britânica com sete birdies.
"Gosto de perseguir", disse Hull, ainda sem um título importante depois de vários vice-campeonatos, incluindo o Open Britânico Feminino de 2023: "É mais divertido dessa forma".
A número um do mundo, Nelly Korda, deve terminar a temporada de majors sem um título depois de jogar 74 no sábado e cair nove pancadas atrás.
Empatada em 36.º lugar, num grupo que também inclui a atual campeã da Nova Zelândia, Lydia Ko, a americana está agora há 13 torneios sem vencer e pode perder a sua classificação de número um para a tailandesa Jeeno Thitikul, dependendo do desfecho da jornada final deste domingo.