A penalização de 10 segundos do britânico, por não ter abrandado quando as bandeiras foram agitadas em resposta a detritos na pista, custou pontos cruciais na luta pelo campeonato com a Ferrari.
A penalização, que custou efetivamente mais de 30 segundos no total, fez Norris cair do segundo lugar da geral para o fundo do pelotão, antes de o britânico regressar ao 10.º lugar com a volta mais rápida.
Jenson Button, o campeão do mundo de 2009 e antigo piloto da McLaren, disse aos telespectadores da Sky Sports que a penalização parecia "incrivelmente extrema".
Stella disse aos jornalistas que os dados confirmavam que Norris não tinha abrandado, mantendo-se efetivamente na mesma posição, mas que as bandeiras amarelas eram inconsistentes - acionadas e depois retiradas, apesar de a situação da pista se manter inalterada.
"A falta de qualquer especificidade e proporção é muito preocupante. E é também um fator que pode ter um impacto decisivo na luta pelo campeonato. É definitivamente um material que a FIA deve considerar muito seriamente se quisermos que a justiça faça parte das corridas na Fórmula 1", analisou o diretor da McLaren.
Stella disse ainda confiar na tomada de decisão da FIA, mas espera que o órgão reveja as suas operações e a aplicação da penalidade, mesmo que seja tarde demais para fazer qualquer coisa sobre o resultado da corrida.
"Há certamente, na nossa opinião, material para melhorar", acrescentou, sem comentar a recente mudança de diretor de prova.
A McLaren, que ganhou o título de construtores pela última vez em 1998 e antes de qualquer um dos seus actuais pilotos ter nascido, tem 21 pontos de vantagem sobre a Ferrari, com 44 ainda por ganhar em Abu Dhabi no próximo fim de semana.
Ambos os seus pilotos alinharam à frente da dupla da Ferrari, Charles Leclerc e Carlos Sainz, na partida.
Stella sugeriu que a situação parecia a de alguém que pegasse num livro coberto de pó e o abrisse para ver o que dizia e depois o aplicasse.
Norris, cujo colega de equipa australiano Oscar Piastri terminou em terceiro, culpou-se a si próprio e pediu desculpa pelo que considerou ser um erro dispendioso.
"Tornei o trabalho da equipa muito mais difícil do que era necessário. A equipa está a fazer um excelente trabalho, mas eu desiludi-os", afirmou.
No entanto, Stella disse que ele não deveria ser tão duro consigo mesmo.
"O que posso dizer é que estamos em posição de ir para a última corrida liderando o campeonato porque os nossos dois pilotos fizeram um trabalho incrível, e isso nos deu os pontos que nos dão a liderança. E Lando tem sido o principal contribuinte para colocar a McLaren nesta condição", rematou.