Schwalger, 46 anos, estava suspenso desde setembro, depois de ter sido acusado de conduta sexual imprópria com uma menor de 16 anos.
"Mase deu tudo ao nosso país através da Manu Samoa, e as suas contribuições para a equipa e para a nossa comunidade do râguebi serão sempre reconhecidas. A sua liderança tem sido uma parte fundamental do nosso percurso", afirmou o presidente da Lakapi Samoa, Sailele Malielegaoi, em comunicado.
Schwalger, antigo jogador do Scarlets e do Sale, foi nomeado em abril.
"A demissão segue-se a um período de suspensão concedido a Mase após a apresentação de acusações criminais contra ele em tribunal", disse Lakapi Samoa.
O Lakapi Samoa disse que a procura de um novo treinador principal vai começar com o desporto no país em turbulência.