Juntamente com o prestigiado Troféu Paul Hunter, a vitória rende a Murphy 350.000 libras esterlinas, pois terminou a partida com uma tremenda quebra de século.
Wilson montou uma recuperação notável na sessão da noite, depois de estar a perder por 6-2 ao intervalo, ganhando cinco dos primeiros sete quadros com impressionantes quebras de 95, 78 e 65 para reduzir a desvantagem para apenas um quadro em 8-7.
No entanto, Murphy manteve a calma nos pontos críticos, particularmente depois de Wilson ter falhado um longo vermelho para o canto direito no 16.º frame, permitindo a Murphy compilar um valioso 55 e ficar a um frame da vitória.
Murphy acabou por selar o acordo com o seu quarto século de jogo, pondo fim a uma seca de 10 anos em eventos da Tripla Coroa.
"Não posso acreditar - estou em choque", disse Murphy à BBC.
"Para ser totalmente honesto, pensei que estes dias já tinham passado. Quando perdi para o Mark Selby em 202 no Crucible, pensei que os meus dias no final destes eventos tinham acabado. Mas toda a gente sabe que fiz equipa com o Peter Ebdon e ele ajudou-me a redescobrir a autoconfiança, ajudou-me a lembrar-me que já fui muito bom nisto. Ainda há um pouco de vida no velho cão", acrescentou.
"Tenho de prestar homenagem ao Kyren - ele é um grande campeão do mundo. Ele atacou-me a sério e houve uma fase, há uns frames atrás, em que foi um momento de pânico", assumiu.
Wilson disse após a derrota que não lutou o suficiente contra o eventual vencedor.
"Hoje tornei as coisas demasiado fáceis para o Shaun", disse Wilson à BBC.
"Atirei-o às bolas demasiadas vezes e não se pode fazer isso com o quão bem o Shaun tem jogado esta semana. Provei porque é que sou o campeão do mundo, lutei o mais que pude. Quando estava a perder por 8-4, muitas pessoas teriam desistido de mim e, se a bola vermelha entrasse a 8-7, poderia ter sido o meu apuramento para 8-8 e o resultado poderia ser diferente. Mas o mérito é todo do Shaun - muito bem para o Shaun", acrescentou.
Shaun Murphy assumiu uma liderança de 6-2 sobre o campeão mundial Kyren Wilson na sessão de abertura no início da tarde.
Murphy, que conseguiu uma quebra máxima de 147 na sua vitória nas meias-finais sobre Mark Allen, dominou os primeiros tempos.
Uma quebra de 94 no primeiro quadro deu o tom e ele aumentou sua vantagem para 3-1 no intervalo da sessão.
Wilson, que foi derrotado por Allen na final de 2018, lutou para encontrar o seu ritmo enquanto procurava a sua primeira coroa de Masters da carreira.
Ele recuperou brevemente, vencendo o sexto quadro com uma quebra de meio século para reduzir a diferença para 4-2.
No entanto, Murphy rapidamente recuperou o controlo, compilando duas quebras de século consecutivas para estabelecer uma forte vantagem a caminho da sessão final na noite deste domingo.