Murphy, que conseguiu uma quebra máxima de 147 na sua vitória nas meias-finais sobre Mark Allen, dominou os primeiros tempos.
Uma quebra de 94 no primeiro quadro deu o tom e ele aumentou sua vantagem para 3-1 no intervalo da sessão.
Wilson, que foi derrotado por Allen na final de 2018, lutou para encontrar o seu ritmo enquanto procurava a sua primeira coroa de Masters na carreira.
Ele recuperou brevemente, vencendo o sexto quadro com uma quebra de meio século para reduzir a diferença para 4-2. No entanto, Murphy rapidamente recuperou o controlo, fazendo duas quebras de século consecutivas para estabelecer uma forte vantagem a caminho da sessão final na noite de domingo.
Murphy, de 42 anos, está a tentar conquistar o seu primeiro título de Masters desde 2015.
O vencedor deste segundo evento da época receberá o Troféu Paul Hunter e um primeiro prémio de 350.000 libras (414 mil euros).
A final à melhor de 19 quadros será retomada a partir das 19:00.