Boniface regressou de lesão no sábado, mas ficou no banco no empate 2-2 do Leverkusen com o RB Leipzig, depois de a imprensa alemã o ter associado a uma transferência para o Al Nassr, da Arábia Saudita.
Depois disso, ficou de fora do treino antes da vitória do Leverkusen por 2-0 na Liga dos Campeões contra o Sparta Praga, da República Checa, na quarta-feira.
"Amanhã volta a treinar. Acredito que ele vai ficar connosco", disse Alonso aos jornalistas após a vitória.
"Por isso, tenho de dizer que estou satisfeito, estou feliz. Ele está confortável aqui, por isso não acredito que isto seja um grande stress para ele", acrescentou.
O nigeriano marcou oito golos em 15 jogos em todas as competições. Na época passada, marcou 14 golos em 23 jogos na Bundesliga, sendo o melhor marcador da equipa e desempenhando um papel fundamental na conquista do primeiro título alemão pelo Leverkusen.
A permanência de Boniface no Leverkusen pode abrir as portas para que Jhon Duran, do Aston Villa, vá para o Al Nassr.
O avançado colombiano é também um dos alvos do clube saudita, que procura reforçar uma linha da frente que já conta com Cristiano Ronaldo e Sadio Mané.