Já no final de sábado, o Bayern anunciou que Gnabry vai ficar afastado dos relvados por um "período prolongado" devido a uma distensão nos adutores.
Os campeões da Bundesliga em título não especificaram quanto tempo Gnabry deverá estar ausente.
Vários meios de comunicação alemães avançaram este domingo que o antigo avançado do Arsenal deverá parar entre dois a três meses, o que o deixaria de fora do Mundial, que arranca a 11 de junho.
"Lamento muito pelo Serge. Esta é uma notícia especialmente amarga no final da época, com tantos jogos grandes e importantes pela frente," afirmou Nagelsmann em comunicado à subsidiária da AFP, SID.
O treinador, que também orientou Gnabry enquanto esteve no comando do Bayern, revelou que falou com o jogador de 30 anos no sábado, assim que o diagnóstico ficou confirmado.
"Disse-lhe que, na seleção, estamos todos com ele. Vamos apoiá-lo da melhor forma possível para que possa regressar ao relvado o mais depressa possível".
Gnabry recuperou a sua melhor forma esta época, integrando um ataque do Bayern em grande nível ao lado de Harry Kane, Michael Olise e Luis Diaz. O Bayern já garantiu presença nas meias-finais da Liga dos Campeões e da Taça da Alemanha, podendo conquistar a Bundesliga já este domingo.
Em 21 jogos do campeonato esta temporada, soma oito golos e sete assistências, sendo considerado uma escolha certa para o grupo de Nagelsmann no Mundial, caso estivesse em condições.