O jogador de 24 anos sofreu a lesão na derrota de sábado por 0-2 com o Manchester City nos quartos de final da Taça de Inglaterra, que acabou com as esperanças do Newcastle de conquistar um título esta temporada.
Botman também vai falhar a campanha dos Países Baixos, no Euro-2024.
"Sven Botman vai ser operado na próxima semana, depois de ter sofrido uma lesão no joelho contra o Manchester City", afirmou o Newcastle em comunicado.
"Um exame confirmou que sofreu uma lesão no seu ACL e espera-se que ele volte dentro de seis a nove meses", acrescentou o clube inglês.
"Desejamos-te uma recuperação completa e rápida, Sven", completou o Newcastle.
As lesões dos principais jogadores têm sido um dos principais fatores de uma época dececionante para o Newcastle.
Apoiado pelo fundo soberano da Arábia Saudita, o clube terminou em quarto lugar na Premier League na época passada, alcançando a Liga dos Campeões pela primeira vez em 20 anos.
Mas os Magpies foram eliminados da Liga dos Campeões na fase de grupos, ocupam o 10.º lugar na Premier League e não conseguiram acabar com a sua espera por um primeiro grande troféu desde 1969 nas taças nacionais.