O treinador do City está atualmente afastado após a cirurgia da semana passada, mas espera-se que regresse após a próxima pausa internacional.
Lillo supervisionou a deslocação dos tricampeões da Premier League ao Sheffield United na semana passada e permanecerá no comando para o jogo de sábado contra o Fulham.
"Falo regularmente com ele. Ele está muito melhor e as coisas estão a acontecer da forma que devem acontecer. Todos nós estamos muito contentes e ansiosos pelo seu regresso", disse Lillo numa conferência de imprensa.
O adjunto espanhol manteve-se em contacto com Guardiola durante a vitória do City em Bramall Lane, no passado domingo, e manteve-se em contacto com o espanhol antes da visita do Fulham ao Estádio Etihad.
"É o mesmo que no jogo anterior. Com Pep haveria mais energia, mas estamos sempre em contacto com ele. Partilhamos bem as nossas responsabilidades, temos as nossas funções muito bem definidas por ele e vamos continuar no bom caminho, mas é óbvio que ele continua a dar o seu contributo", defendeu Lillo.