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Shnaider venceu o primeiro set com facilidade, mas ficou em dificuldades depois de deixar escapar o segundo e teve de salvar três pontos de break no início do set decisivo, antes de selar a vitória ao fim de duas horas e 18 minutos.
A jogadora de 22 anos conquistou agora seis finais consecutivas no circuito WTA.
"Quero agradecer e dar os parabéns ao meu treinador, que está aqui comigo, por conquistarmos o nosso primeiro título da época", disse Shnaider.
"Significa muito para mim, é uma grande conquista e um excelente fecho de época".
Fernandez disputava a segunda final consecutiva, depois de ter perdido para a número um mundial Elena Rybakina no Open de Ningbo, na semana passada.
"Gostaria de dar os parabéns à Diana. Parabéns. Foi uma semana incrível, um grande jogo. Parabéns a ti e à tua equipa. Espero que possamos ter muitas mais batalhas como esta", afirmou a canadiana, vencedora do Open de Singapura em setembro.